Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TTC29Q8NA56 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TTC29Q8NA56 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms