Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWDEQ8N2E2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWDEQ8N2E2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms