Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL34Q8N239 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL34Q8N239 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms