Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WDR53Q7Z5U6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms