Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMC4Q7Z404 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMC4Q7Z404 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms