Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP54Q7Z3B4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP54Q7Z3B4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms