Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCF23Q7RTU1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCF23Q7RTU1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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