Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SV2AQ7L0J3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms