Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TMUB2Q71RG4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMUB2Q71RG4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms