Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYDE1Q6ZW31 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYDE1Q6ZW31 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms