Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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C9orf47Q6ZRZ4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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