Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC141Q6ZP82 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC141Q6ZP82 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms