Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SUSD1Q6UWL2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD1Q6UWL2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms