Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms