Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHBDD2Q6NTF9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms