Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms