Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms