Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USPL1Q5W0Q7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms