Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRIP1Q5VSL9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STRIP1Q5VSL9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms