Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOGA3Q5TF21 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOGA3Q5TF21 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms