Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FRMPD1Q5SYB0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FRMPD1Q5SYB0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms