Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC158Q5M9N0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms