Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDCA8Q53HL2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDCA8Q53HL2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms