Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
C4orf17Q53FE4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C4orf17Q53FE4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms