Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BSXQ3C1V8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BSXQ3C1V8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms