Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RRN3P1Q2M238 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RRN3P1Q2M238 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms