Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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