Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ECM1Q16610 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ECM1Q16610 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ECM1Q16610 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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