Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZNF239Q16600 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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