Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK5Q16478 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK5Q16478 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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