Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC85BQ15834 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC85BQ15834 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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