Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SS18Q15532 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SS18Q15532 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms