Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NCAPHQ15003 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCAPHQ15003 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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