Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BECN1Q14457 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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