Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DDX39BQ13838 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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