Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALCAMQ13740 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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