Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1SQ13698 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms