Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PKD2Q13563 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PKD2Q13563 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PKD2Q13563 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PKD2Q13563 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PKD2Q13563 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PKD2Q13563 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKD2Q13563 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms