Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAMK2BQ13554 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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