Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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FOXE3Q13461 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXE3Q13461 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FOXE3Q13461 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXE3Q13461 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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