Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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