Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
GRIN2BQ13224 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2BQ13224 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2BQ13224 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
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