Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BNIP3Q12983 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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