Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.274e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-205ENST00000504359 565 ntTSL 416.24■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.094e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-218ENST00000511736 956 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.24e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-220ENST00000515326 1050 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.534e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-216ENST00000510026 2599 ntTSL 510.99□□□□□ -0.654e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-212ENST00000509156 2063 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.694e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-213ENST00000509341 572 ntTSL 510.3□□□□□ -0.764e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 LINC01004-202ENST00000450686 538 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.796e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-207ENST00000507218 1352 ntTSL 1 (best)8.01□□□□□ -1.134e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.334e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.664e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.826e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ZNF131-210ENST00000508259 501 ntTSL 52.19□□□□□ -2.064e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.614e-8■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.744e-8■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.794e-8■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 BAZ2A-209ENST00000549763 657 ntTSL 39.34□□□□□ -0.914e-8■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 BAZ2A-205ENST00000547650 614 ntTSL 38.66□□□□□ -1.024e-8■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 AKR1C1-203ENST00000442997 744 ntTSL 310.35□□□□□ -0.758e-8■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 AKR1C1-205ENST00000477661 2637 ntTSL 56.89□□□□□ -1.318e-8■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 LSM2-209ENST00000470083 641 ntTSL 212.04□□□□□ -0.482e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 LSM2-214ENST00000493387 767 ntTSL 511.38□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 14.4
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ILF3Q12906 LSM2-210ENST00000470086 713 ntTSL 28.12□□□□□ -1.112e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 LSM2-211ENST00000475835 211 ntTSL 53.84□□□□□ -1.792e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 520.7■□□□□ 0.92e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 LARP4-208ENST00000520064 2068 ntTSL 510.29□□□□□ -0.761e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 DDX10-201ENST00000322536 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-14■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.843e-14■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.446e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 SLC35F5-209ENST00000469702 784 ntTSL 38.59□□□□□ -1.036e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.187e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.527e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 UBXN2A-203ENST00000446425 2195 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.097e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.514e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 418.84■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 315.7■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 CD46-216ENST00000490278 747 ntTSL 23.76□□□□□ -1.813e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 CD46-215ENST00000488596 872 ntTSL 33.06□□□□□ -1.923e-9■■□□□ 14.3
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ILF3Q12906 DNM1-207ENST00000482638 672 ntTSL 58.9□□□□□ -0.981e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.941e-8■■□□□ 14.3
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ILF3Q12906 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.191e-8■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 TMEM41B-201ENST00000299596 1443 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.191e-8■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 TMEM41B-202ENST00000524543 3848 ntTSL 210.74□□□□□ -0.691e-8■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 EPB41-208ENST00000460378 5212 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.773e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 EPB41-209ENST00000462032 752 ntTSL 25.67□□□□□ -1.53e-6■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 EPB41-212ENST00000490308 354 ntTSL 32.41□□□□□ -2.023e-6■■□□□ 14.3
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ILF3Q12906 FBXO31-206ENST00000569412 431 ntTSL 54.94□□□□□ -1.621e-6■■□□□ 14.3
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ILF3Q12906 RBCK1-209ENST00000415942 2613 ntTSL 515.86■□□□□ 0.131e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.071e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 RBCK1-204ENST00000382214 2752 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.081e-9■■□□□ 14.3
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ILF3Q12906 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.683e-7■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 GPBP1L1-207ENST00000480083 964 ntTSL 221.5■■□□□ 1.031e-8■■□□□ 14.3
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ILF3Q12906 PANK2-203ENST00000464452 771 ntTSL 311.19□□□□□ -0.622e-7■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.731e-8■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 GPBP1L1-208ENST00000480941 850 ntTSL 27.98□□□□□ -1.131e-8■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.171e-8■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 GPBP1L1-203ENST00000460859 559 ntTSL 23.86□□□□□ -1.791e-8■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 GPBP1L1-211ENST00000493083 725 ntTSL 23.34□□□□□ -1.871e-8■■□□□ 14.3
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ILF3Q12906 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-39■■□□□ 14.3
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ILF3Q12906 UTP11-201ENST00000373014 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.814e-11■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 UTP11-203ENST00000486563 750 ntTSL 29.3□□□□□ -0.924e-11■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.28e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.228e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.418e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.538e-9■■□□□ 14.3
ILF3Q12906 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.348e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.348e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.048e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.078e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 AC009163.4-202ENST00000561887 137 ntTSL 212.46□□□□□ -0.418e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 AC009163.4-203ENST00000566594 254 ntTSL 212.46□□□□□ -0.418e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.478e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TMEM170A-205ENST00000568559 4345 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.58e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TMEM170A-204ENST00000567796 734 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.938e-7■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.266e-8■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.036e-8■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 514.15□□□□□ -0.146e-8■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.117e-10■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.547e-10■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.031e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.721e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-213ENST00000471793 1779 ntTSL 218.33■□□□□ 0.531e-6■■□□□ 14.2
ILF3Q12906 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.091e-6■■□□□ 14.2
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