Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC173Q0VFZ6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms