Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FAM27E3Q08E93 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms