Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACSM1Q08AH1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACSM1Q08AH1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms