Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DQ08499 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms