Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PLCB3Q01970 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PLCB3Q01970 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms