Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL20P78556 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCL20P78556 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCL20P78556 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CCL20P78556 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL20P78556 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL20P78556 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL20P78556 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL20P78556 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL20P78556 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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